مسجد سید اصفهان یکی از آثار باشکوه دور قاجار است که این روزها به دلیل مصرف نادرست آبهای زیرزمینی، نشانه‌های فرونشست در آن به وضوح قابل مشاهده است. نشست نامتقارن زمین که ناشی از فرونشست و برداشت بی‌رویه آب‌های زیرزمینی است، باعث ایجاد ترک در زمین شده، به مرور این ترک‌ها به سازه بنای مسجد سید منتقل شده‌اند و شاهدهای گچی در پشت و روی دیوار و گنبد این مسجد نشان می‌دهد که فرونشست در این بنای باشکوه قاجاری همچنان ادامه داد.