در کنار تمامی هنرها و آثار نفیس موجود در مجموعه جهانی شیخ صفی‌الدین اردبیلی، صندوقچه‌های چوبی قبرهای این مجموعه که با استفاده از هنرهای مختلف صنایع‌دستی تهیه شده‌اند آثار شاخصی محسوب می‌شوند. در این مجموعه تعداد چهارده صندوقچه قبر وجود دارد که سه مورد از آنها به دلیل ارزش بالا در فهرست آثار ملی به ثبت رسیده‌اند، صندوق قبر شیخ صفی‌الدین اردبیلی با شماره ثبت 728 و صندوق قبر شاه اسماعیل با شماره ثبت 727 در سال 1396 و صندوق قبر محیی الدین محمد با شماره ثبت 1215 در سال 1397 به ثبت رسیده و نفیس‌ترین صندوق قبرهای این مجموعه هستند.